การที่จะได้สารหอมๆ ที่มีคุณภาพดีนั้น ส่วนใหญ่วัตถุดิบที่นำมาสกัดจะต้องมีความสดและมีความเสียหายน้อยที่สุด ไม่ว่าจะเป็นการสกัดจากดอกไม้ รากไม้ หรือจากการเก็บวัตถุดิบเพื่อนำมาใช้ในการสกัด ที่จะทำให้คุณได้พบว่าดอกไม้ที่มีกลิ่นหอมๆ ของไทยบางชนิด ไม่ว่าจะเป็นดอกพิกุล ดอกแก้ว ซึ่งมีขนาดเล็ก และมีความบอบบางทำให้อาจมีปัญหาในการเก็บอย่างมาก โดยเฉพาะดอกพิกุลที่มีฐานรองดอกหนาก็จริง แต่มีขั้วค่อนข้างเหนียวและส่วนใหญ่ดอกยังบานไม่พร้อมกันทั้งช่อซึ่งดูแล้วยุ่งยากต่อการเก็บยิ่งนัก
ชาวบ้านที่เก็บดอกพิกุลไปขายให้กับร้านขายยาแผนโบราณ มีวิธีการเก็บคือส่วนใหญ่จะใช้วิธีกวาดเก็บกลีบดอกที่ร่วงใต้ต้นในตอนเช้าซะมากกว่า แล้วจึงค่อยนำมาทำความสะอาด ซึ่งหากนำมาสกัดเป็นน้ำหอมจะทำให้ได้กลิ่นน้ำหอมที่ไม่ค่อยสด ส่วนดอกแก้วนอกจากจะบานไม่พร้อมกันทั้งช่อแล้ว สังเกตได้ว่ายังมีกลีบดอกที่บอบบางเมื่อบานแล้วก็ส่งผลทำให้ร่วงเร็วอีกด้วย การใช้แรงงานในการเก็บบางคนอาจเก็บได้ในปริมาณน้อยต่อวัน ทำให้ไม่สามารถเก็บดอกไม้ที่มีปริมาณมากได้ทันในวัน ส่วนการใช้เครื่องมือในการช่วยเก็บจึงมีความจำเป็นอย่างมาก เพื่อให้ได้ดอกไม้สดๆ และไม่บอบช้ำมากที่สุด
ดอกไม้ที่มีกลิ่นหอมทั้งวัน อย่างดอกพิกุล หรือดอกจำปี สามารถเก็บได้ตลอดทั้งวัน ส่วนดอกไม้ที่มีกลิ่นหอมแรงเป็นช่วง เวลาอย่าง ดอกลั่นทม ดอกแก้ว และดอกมะนาว อาจใช้เวลาในการเก็บช่วงที่ดอกไม้ให้กลิ่นแรงที่สุด แล้วจึงนำลงถังสกัด ต่อ ส่วนดอกไม้ที่จะนำลงถังสกัดด้วยวิธีสกัดจากตัวทำละลายไม่ควรมีน้ำปนเปื้อนเพราะหากดอกไม้เปียกก็ควรผึ่งให้แห้ง และไม่ควรแช่ดอกไม้ในน้ำแข็งเพราะจะทำให้เกิดความช้ำได้ ไม่ควรเก็บดอกไม้ในช่วงเวลาที่มีฝนตกหรือหลังฝนตกใหม่ๆ เพราะจะทำให้สารหอมที่สกัดได้ มีกลิ่นที่เหม็นบูดปนเปื้อน
การสกัดสารหอมจากดอกไม้ เพื่อให้ได้กลิ่นดอกไม้หอมๆ จากการสกัดออกมาให้กลายเป็นน้ำมันหอม จากการทดลองสกัดสารหอมของดอกไม้ไทยพบว่า ดอกจำปี และดอกมะนาว สามารถสกัดสารหอมได้ด้วยการกลั่นเพื่อให้ได้สารหอมในรูปของน้ำมันหอมระเหย ส่วนดอกมะลิ ดอกลั่นทม ดอกซ่อนกลิ่น ไม่สามารถใช้วิธีการกลั่นได้ แต่วิธีการสกัดที่ทำให้ได้สารหอมที่ดีที่สุดก็คือการสกัดด้วยตัวทำละลาย ทั้งนี้ก็เพื่อทำให้ได้ผลผลิตสุดท้ายที่เรียกว่า แอบโซลูดออยล์ แต่ดอกไม้อื่นๆ อย่างดอกพิกุล ดอกแก้ว หรือกระดังงา และดอกส้ม แม้จะมีรายงานว่าสามารถสกัดได้ด้วยการกลั่น แต่มีการทดลองสกัดด้วยสารเคมีในรูปของแอบโซลูดออยล์ จะทำให้เกิดเป็นสารหอมๆ ออกมาได้ง่ายกว่า